生物医学信息学

引用

Shortliffe, E. H., & Cimino, J. J. (Eds.). (2021). Biomedical Informatics: Computer Applications in Health Care and Biomedicine (5th ed.). Springer.

章节概要

这是该教材的第五版；其第二版（2001）的书名是 Medical Informatics: Computer Applications in Health Care and Biomedicine。从第三版起改名为 Biomedical Informatics，现由 Edward Shortliffe 和 James Cimino 主编。全书是多位作者合写的三十章，各章由相应领域的专家撰写，内容从本领域的基础，经主要应用领域和政策，到以“生物医学信息学的未来”收束的末章。

第1–3章：基础

第1章“生物医学信息学：科学与实践”界定本领域。第2章“生物医学数据：获取、存储与使用”讲系统处理的数据。第3章“生物医学决策：概率性临床推理”讨论不确定性下的推理，这一主题延续到接近结尾的决策支持一章。

第4–8章：人、软件、标准与语言

第4章“认知信息学”和第5章“人机交互、可用性与工作流程”考察人如何思考以及如何与信息系统协同工作。第6章“医疗保健与生物医学的软件工程”和第7章“生物医学信息学中的标准”讲系统的构建和使其互操作的标准。第8章“健康相关文本的自然语言处理”讨论从文本中提取信息。

第9–11章：生物信息学、影像与个人健康

第9章“生物信息学”和第10章“生物医学影像信息学”涉及本领域的生物和影像两端。第11章“个人健康信息学”转向面向个人的工具。

第12–13章：伦理与评价

第12章“生物医学与健康信息学中的伦理：用户、标准与结果”和第13章“生物医学与健康信息资源的评价”讨论负责任的使用，以及系统是否有效的问题。

第14–18章：病历、基础设施、机构与照护

第14章“电子健康档案”领起这一组，其余是“健康信息基础设施”（15）、“医疗机构中的信息管理”（16）、“以患者为中心的照护系统”（17）以及“人群与公共卫生信息学”（18），从病历延伸到机构、照护提供和人群。

第19–24章：照护技术与知识系统

第19章“移动健康及其应用”、第20章“远程医疗与远程健康”、第21章“患者监护系统”和第22章“放射学中的影像系统”涵盖用于照护的技术。第23章“信息检索”和第24章“临床决策支持系统”涉及服务于临床医生检索和推理的系统。

第25–30章：教育、转化研究、政策与未来

第25章“健康科学教育中的数字技术”、第26章“转化生物信息学”、第27章“临床研究信息学”和第28章“精准医学与信息学”把应用延伸到教学和研究。第29章“健康信息技术政策”讲政策，第30章“生物医学信息学的未来”为全书收尾。

核心概念

第1–8章

• 生物医学数据：临床和生物数据的获取、存储与使用。
• 概率性临床推理：不确定性下的决策。
• 认知信息学与可用性：人的认知和工作流程如何塑造系统设计。
• 标准：使系统能交换信息的约定。

第9–18章

• 生物信息学与影像信息学：面向分子数据和图像的信息学。
• 评价：判断信息资源的价值。
• 电子健康档案与健康信息基础设施：病历及其周围的网络。
• 人群与公共卫生信息学：面向群体而非个体的信息学。

第19–30章

• 移动健康、远程健康与患者监护：诊所之外的照护技术。
• 临床决策支持与信息检索：帮助临床医生查找和运用知识的系统。
• 转化生物信息学、临床研究信息学与精准医学：连接研究与照护的信息学。
• 健康信息技术政策：部署所处的政策环境。

评析

优点

• 一卷之中涵盖面广。 三十章涉及数据、推理、人因、软件、标准、伦理与评价，继而是病历、照护技术、研究信息学、政策和未来。
• 专家撰写。 各章由署名专家撰写，例如 Hersh 撰写信息检索，Bates 是政策一章的作者之一；主编 Shortliffe 和 Cimino 参与了首末章。
• 先基础后应用。 第1至13章先建立数据、决策、可用性、标准和评价等概念，应用章节再依托这些概念。
• 长期使用的参考书。 本书源于最初以 Medical Informatics 为名出版的教材，已修订至第五版，因此既有本领域积累的框架，也有当前的主题。

局限

• 编著形式。 多位作者合写的书在各章之间风格和深度会有差异，三十章使它更像可以随时查阅的参考书。
• 参考书的规模。 三十章出自众人之手，适合挑选着读；从头读到尾是一项大工程。
• 书名与版本变化。 早先的 Medical Informatics 章节不同，旧课程材料中的章节编号无法对应；用旧书名检索也找不到这一版。

在课程中的定位

在本课程的书目中，这是该学科宽广而权威的教科书。Enrico Coiera 的 Guide to Health Informatics 和 Health Informatics: Practical Guide 是篇幅较短、较新的广泛入门书，更适合作为第一本。William Hersh 的 Information Retrieval: A Biomedical and Health Perspective 把一条线索展开，对应这里的第23章。Principles of Health Interoperability 深入讲第7章涉及的标准，Robert Wachter 的 The Digital Doctor 是关于美国医学数字化的纪实，可作为病历和决策支持章节的有益补充。

可在读过较短的入门书之后阅读本卷，或在某一章需要更多深度时与专门的书配合使用。

如何使用本书

本书适合健康与生物医学信息学的研究生和从业者，以及需要了解计算技术能在临床服务和生物医学研究中做什么的研究人员。

实用的阅读计划：

• 核心： 第1至3章，然后是讲人、软件和标准的第4至7章。
• 随后： 讲伦理与评价的第12、13章，再读病历和基础设施各章（第14至18章）。
• 按兴趣选读： 第9、10章（生物信息学与影像），第19至22章（照护技术），第23、24章（检索与决策支持），第26至28章（研究与精准医学）。
• 收尾： 第29、30章，了解政策与展望。