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Genes: A Very Short Introduction(基因:簡明導論) cover

生物學

生物學

Genes: A Very Short Introduction(基因:簡明導論)

Jonathan Slack

英文原名: Genes: A Very Short Introduction

強納森・斯萊克所寫的精簡入門書,探討「基因」一詞的不同意義。2023年第二版新增了CRISPR、DNA剖繪與古DNA的內容。書中從孟德爾談到DNA,再討論突變、作為標記的基因、微效基因與遺傳率,以及演化中的基因。

需要的基礎: 不需先修遺傳學,具備高中生物程度會有幫助。

難度等級
入門
學術層次
大學部
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01 / 導讀

導讀

引用

Slack, J. (2023). Genes: A Very Short Introduction (2nd ed.). Oxford University Press.

章節概要

這個第2版於2023年4月出版,篇幅約160頁,包括序言和插圖目錄、六章正文和結論、延伸閱讀、名詞解釋和索引。出版社稱本版經過全面修訂,新增了關於標的式基因改造方法CRISPR、DNA圖譜分析,以及古DNA所揭示的人類祖先等內容的小節。本書的組織方式與其說是逐一講解機制,不如說是說明生物學家和社會科學家用「基因」一詞所指的各種不同意義,並在結論中加以歸納。

第1章:1944年以前的基因

開篇一章追溯基因概念的發展,從1866年孟德爾對遺傳因子的研究,到1944年奧斯瓦德·艾佛瑞把「轉形因子」鑑定為DNA的論文。本章說明,遺傳的實驗研究與DNA化學這兩條獨立的研究路線在20世紀中葉匯合,催生了分子生物學,並將其與先前育種者在不了解生殖原理的情況下形成的「血統」觀念對照。

第2章:作為DNA的基因

1944年之後,一連串發現奠定了現代分子生物學,首先是雙螺旋結構,它說明了DNA如何能夠作為遺傳物質。本章介紹基因的結構,解釋「基因體」和「基因體學」這兩個術語;接著講述1970至80年代基因調控機制的發現(包括涉及DNA甲基化的機制)、1980至90年代對胚胎發育遺傳控制的發現、2003年完成的人類基因體序列,以及對微生物、植物和動物進行基因改造的方法,關於CRISPR的新內容就放在這個脈絡中。

第3章:突變與基因變異型

所有基因變異型都源於突變,但任何個體所帶有的變異型大多是遺傳而來,而非新近產生。本章說明為什麼只有生殖細胞中的突變才會傳給後代,以囊腫纖維化、血友病和軟骨發育不全為例,說明依照簡單孟德爾法則遺傳的單基因疾病,並把癌症解釋為一個體細胞中多個突變累積的結果;遺傳易感性則被解釋為減少了所需新突變的數目。

第4章:作為標記的基因

大多數遺傳變異並不改變基因的功能,但仍然提供大量資訊。本章介紹鑑識科學中的DNA指紋、親子關係和其他親屬關係的鑑定,以及近來從DNA推斷一個人部分外貌的可能性。接著轉向人類遷徙:以粒線體DNA追溯母系、以Y染色體追溯父系,考古標本中古DNA的貢獻,族群間差異對於「種族」是否有生物學基礎這個問題的啟示,以及消費者使用的祖源檢測套組。

第5章:微效基因

許多性狀取決於大量基因,每個基因只產生很小的效應。本章說明這個假設如何引導動植物育種,以及為什麼把它套用在人類身上時會引起爭議。它討論遺傳率,也就是族群中可歸因於遺傳變異的變異比例,涉及人類身高、嚴重精神疾病和智商,同時介紹全基因體關聯研究,以及根據個人帶有的變異型預測特定疾病風險的能力日益提高。

第6章:演化中的基因

本章檢視基因概念對演化理論造成的影響。它區分了創造新事物的天擇與由遺傳漂變導致的中性演化;後者解釋了DNA序列的大量變化,並使根據DNA為生物分類成為可能。本章討論性和利他行為這兩個難題:在這些情形中,散播基因變異型的東西似乎以犧牲個體為代價而有利於群體。最後介紹演化心理學,這個學派主張人類信念和行為的普遍特徵是經由生物演化形成的。

結論:基因的多種概念

結論把全書使用的「基因」的不同意義並列起來:分子生物學家所說、具有確定功能的DNA序列;族群和祖源研究中用作標記的變異型;數量遺傳學中假定的微效基因;演化理論中假定會影響行為的變異型;以及演化心理學所主張的普遍屬性的遺傳基礎。

核心概念

第1–2章:基因是什麼

  • 轉形因子:1944年艾佛瑞鑑定為DNA的物質,把基因與一種化學物質連結起來。
  • 基因體與基因體學:生物的全部DNA,以及對其整體的研究。
  • 基因調控與DNA甲基化:控制基因何時活躍,包括對DNA的化學標記。
  • 基因改造與CRISPR:改變生物的基因,如今包括標的式編輯。

第3–4章:變異

  • 基因變異型:基因的另一種形式,最初由突變產生,通常是遺傳而來。
  • 生殖細胞突變與體細胞突變:只有生殖細胞中的變化才會傳給後代。
  • 遺傳標記:不改變功能、但可用來辨識個體或追溯世系的變異型。
  • 粒線體DNA與Y染色體:分別追溯母系和父系血統的標記。

第5–6章與結論:族群與演化

  • 遺傳率:族群中某一性狀的變異裡由遺傳變異造成的部分,並不表示某個個體的性狀在多大程度上是「遺傳的」。
  • 全基因體關聯研究(GWAS):在整個基因體中搜尋與性狀或疾病相關的變異型。
  • 遺傳漂變與中性演化:與天擇無關的變異型頻率隨機變化。
  • 基因的諸種概念:本書最後對這個詞的分子、標記、數量和演化等意義所作的區分。

評析

優點

  • 釐清「基因」的意義。 出版社簡介中提出、並在結論中明確闡述的核心觀點是:分子生物學家、族群生物學家和社會科學家使用這個詞的意義各不相同。這個區分有助於跨遺傳學、演化和社會科學閱讀的學生避免雞同鴨講。
  • 正面處理有爭議的主題。 遺傳率與智商、嚴重精神疾病、種族的生物學基礎以及演化心理學都有討論,而且是透過定義(遺傳率是針對族群的量度)而非口號來展開。
  • 經過修訂的第2版。 2023年版增加了CRISPR、DNA圖譜分析和關於人類祖先的古DNA研究,應用部分比2014年的第1版更新。
  • 便於查閱的輔助內容。 名詞解釋和插圖目錄幫助沒有科學背景的讀者;出版社所附的推薦語中,包括史蒂夫·瓊斯稱本書「簡短、犀利、切中要點」的評語。

局限

  • 機制講解被壓縮。 基因結構、基因調控、發育控制、基因體定序和基因改造全都集中在「作為DNA的基因」一章。需要詳細了解分子過程的學生必須求助於教科書。
  • 幾乎沒有形式遺傳學。 孟德爾遺傳以歷史敘述和單基因疾病的形式出現,但從目錄看,遺傳學課程中作為解題核心的雜交、連鎖和基因定位並無專門論述,書中也沒有習題。
  • 刻意簡短。 全書約160頁,GWAS、遺傳漂變和演化心理學等主題各自只有一節左右的篇幅;繼續深入要靠延伸閱讀書目。

在課程中的定位

在遺傳學課程的書單中,本書技術性最低,較適合作為背景讀物而非課程教科書。Alison Thomas 的 Introducing Genetics: From Mendel to Molecules 是教科書中較平易的一本:一本簡短的大學入門教科書,從孟德爾和染色體談到分子遺傳學、突變和族群,提供了斯萊克那些隨筆式章節沒有嘗試的具體講解。Griffiths 等人的 Introduction to Genetic Analysis 以及 Snustad 和 Simmons 的 Principles of Genetics 是內容全面的主教科書,前者尤其以解題為主軸。

兩本專門著作分別延續特定章節。第5章和第6章(遺傳率、漂變與天擇)自然通往 Hartl 和 Clark 的 Principles of Population Genetics,這是一部探討對偶基因頻率如何變化的標準理論教科書。第2章對基因體的介紹則通往 Terry Brown 的 Genomes 5,該書在全基因體層次討論遺傳學,涵蓋基因體的定序、表現和演化。為了先建立概念架構,宜先讀斯萊克,或與主教科書同時閱讀。

如何使用本書

本書適合具備高中生物知識或完全沒有相關背景的讀者:即將學習遺傳學的學生;在心理學、人類學、法律或社會科學中接觸到有關基因和遺傳率說法的學生;以及一般讀者。全書可以分幾次讀完。

實用的閱讀計畫如下:

  • 依序閱讀。 第1–2章確立了基因是什麼以及這個答案如何形成,後面各章都以此為基礎。
  • 細讀第5章。 遺傳率是生物學以外最常被誤解的概念。把族群層次的定義寫下來,並檢查每個例子(身高、精神疾病、智商)是如何使用它的。
  • 關注應用可讀第4章。 鑑識科學、親子鑑定、祖源檢測和種族問題集中在這一章。
  • 以結論收尾, 然後重讀與課程最相關的「基因」意義所對應的章節。

本書提供概念但沒有習題,因此應同時用 Thomas 或 Griffiths 等教科書練習孟德爾雜交和系譜分析題。名詞解釋在閱讀其他資料時也可用來快速查對。