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Genes: A Very Short Introduction(基因:简明导论) cover

生物学

生物学

Genes: A Very Short Introduction(基因:简明导论)

Jonathan Slack

英文原名: Genes: A Very Short Introduction

乔纳森·斯莱克所写的简短入门书,讨论“基因”一词的不同含义。2023年第二版增加了CRISPR、DNA图谱分析和古DNA的内容。书中从孟德尔讲到DNA,再讨论突变、作为标记的基因、微效基因与遗传力,以及进化中的基因。

需要的基础: 无需事先学习遗传学,具备高中生物知识会有帮助。

难度等级
入门
学术层次
本科
geneticsgenesinheritancemutationgenomicsvery short introduction

01 / 导读

导读

引用

Slack, J. (2023). Genes: A Very Short Introduction (2nd ed.). Oxford University Press.

章节概要

这一第2版于2023年4月出版,篇幅约160页,包括序言和插图目录、六章正文和结论、延伸阅读、术语表和索引。出版社称本版经过全面修订,新增了关于定向基因改造方法CRISPR、DNA图谱分析以及古DNA揭示的人类祖先等内容的小节。本书的组织方式与其说是逐一讲解机制,不如说是解释生物学家和社会科学家用“基因”一词所指的各种不同含义,并在结论中加以归纳。

第1章:1944年以前的基因

开篇一章追溯基因概念的发展,从1866年孟德尔对遗传因子的研究,到1944年奥斯瓦尔德·埃弗里把“转化因子”鉴定为DNA的论文。本章说明,遗传的实验研究与DNA化学这两条独立的研究路线在20世纪中叶汇合,催生了分子生物学,并将其与此前育种者在不了解生殖原理情况下形成的“血统”观念作对比。

第2章:作为DNA的基因

1944年之后,一系列发现奠定了现代分子生物学,首先是双螺旋结构,它说明了DNA如何能够充当遗传物质。本章介绍基因的结构,解释“基因组”和“基因组学”这两个术语;随后讲述20世纪70至80年代基因调控机制的发现(包括涉及DNA甲基化的机制)、80至90年代对胚胎发育遗传控制的发现、2003年完成的人类基因组序列,以及对微生物、植物和动物进行基因改造的方法,关于CRISPR的新内容就放在这一脉络中。

第3章:突变与基因变异体

所有基因变异体都起源于突变,但任何个体所携带的变异体大多是遗传而来,而非新近产生。本章解释为什么只有生殖细胞中的突变才会传给后代,以囊性纤维化、血友病和软骨发育不全为例,说明按简单孟德尔规律遗传的单基因疾病,并把癌症解释为一个体细胞中多个突变累积的结果;遗传易感性则被解释为减少了所需新突变的数目。

第4章:作为标记的基因

大多数遗传变异并不改变基因的功能,但仍然提供大量信息。本章介绍法医学中的DNA指纹、亲子关系和其他亲属关系的鉴定,以及近来从DNA推断一个人部分外貌的可能性。随后转向人类迁徙:用线粒体DNA追溯母系、用Y染色体追溯父系,古代考古标本中的DNA所作的贡献,群体间差异对于“种族”是否有生物学基础这一问题的启示,以及面向消费者的祖源检测试剂盒。

第5章:微效基因

许多性状取决于大量基因,每个基因只产生很小的效应。本章说明这一假设如何指导动植物育种,以及为什么把它用于人类时会引起争议。它讨论了遗传力,即群体中可归因于遗传变异的变异比例,涉及人类身高、严重精神疾病和智商,同时介绍全基因组关联研究,以及根据个人携带的变异体预测特定疾病风险的能力日益增强。

第6章:进化中的基因

本章考察基因概念对进化理论产生的影响。它区分了创造新事物的自然选择与由遗传漂变导致的中性进化;后者解释了DNA序列的大量变化,并使根据DNA对生物进行分类成为可能。本章讨论了性和利他行为这两个难题:在这些情形中,传播基因变异体的东西似乎以牺牲个体为代价而有利于群体。最后介绍进化心理学,这一学派认为人类信念和行为的普遍特征是经由生物进化形成的。

结论:基因的多种概念

结论把全书使用的“基因”的不同含义并列起来:分子生物学家所说的具有确定功能的DNA序列;群体和祖源研究中用作标记的变异体;数量遗传学中假定的微效基因;进化理论中假定的影响行为的变异体;以及进化心理学所主张的普遍属性的遗传基础。

核心概念

第1–2章:基因是什么

  • 转化因子:1944年埃弗里鉴定为DNA的物质,把基因与一种化学物质联系起来。
  • 基因组与基因组学:生物的全部DNA,以及对其整体的研究。
  • 基因调控与DNA甲基化:控制基因何时活跃,包括对DNA的化学标记。
  • 基因改造与CRISPR:改变生物的基因,如今包括定向编辑。

第3–4章:变异

  • 基因变异体:基因的另一种形式,最初由突变产生,通常是遗传而来。
  • 生殖系突变与体细胞突变:只有生殖细胞中的变化才会传给后代。
  • 遗传标记:不改变功能、但可用于识别个体或追溯世系的变异体。
  • 线粒体DNA与Y染色体:分别追溯母系和父系血统的标记。

第5–6章与结论:群体与进化

  • 遗传力:群体中某一性状的变异中由遗传变异造成的部分,并不表示某个个体的性状在多大程度上是“遗传的”。
  • 全基因组关联研究(GWAS):在整个基因组中搜寻与性状或疾病相关的变异体。
  • 遗传漂变与中性进化:与选择无关的变异体频率的随机变化。
  • 基因的诸种概念:本书最后对这个词的分子、标记、数量和进化等含义所作的区分。

评析

优点

  • 厘清“基因”的含义。 出版社简介中提出、并在结论中明确阐述的核心观点是:分子生物学家、群体生物学家和社会科学家使用这个词的含义各不相同。这一区分有助于跨遗传学、进化和社会科学阅读的学生避免各说各话。
  • 直面有争议的话题。 遗传力与智商、严重精神疾病、种族的生物学基础以及进化心理学都有讨论,而且是通过定义(遗传力是针对群体的度量)而不是口号来展开的。
  • 经过修订的第2版。 2023年版增加了CRISPR、DNA图谱分析和关于人类祖先的古DNA研究,应用部分比2014年的第1版更新。
  • 便于查阅的辅助内容。 术语表和插图目录为没有科学背景的读者提供帮助;出版社所附的推荐语中,包括史蒂夫·琼斯称本书“简短、犀利、切中要害”的评价。

局限

  • 机制讲解被压缩。 基因结构、基因调控、发育控制、基因组测序和基因改造全部集中在“作为DNA的基因”一章中。需要详细了解分子过程的学生必须求助于教科书。
  • 几乎没有形式遗传学。 孟德尔遗传以历史叙述和单基因疾病的形式出现,但从目录看,遗传学课程中作为解题核心的杂交、连锁和基因作图并无专门论述,书中也没有习题。
  • 刻意简短。 全书约160页,GWAS、遗传漂变和进化心理学等话题各自只有一节左右的篇幅;继续深入要靠延伸阅读书目。

在课程中的定位

在遗传学课程的书单中,本书技术性最低,更适合作为背景读物而不是课程教材。Alison Thomas 的 Introducing Genetics: From Mendel to Molecules 是教材中较为平易的一本:一本简短的大学入门教材,从孟德尔和染色体讲到分子遗传学、突变和群体,提供了斯莱克那些随笔式章节没有尝试的具体讲解。Griffiths 等人的 Introduction to Genetic Analysis 以及 Snustad 和 Simmons 的 Principles of Genetics 是内容全面的主教材,前者尤其以解题为主线。

两本专门著作分别延续了特定章节。第5章和第6章(遗传力、漂变与选择)自然通向 Hartl 和 Clark 的 Principles of Population Genetics,这是一部关于等位基因频率如何变化的标准理论教材。第2章对基因组的介绍则通向 Terry Brown 的 Genomes 5,该书在全基因组层面讨论遗传学,涉及基因组的测序、表达和进化。为了先建立概念框架,宜先读斯莱克,或与主教材同时阅读。

如何使用本书

本书适合具备中学生物知识或完全没有相关背景的读者:即将学习遗传学的学生;在心理学、人类学、法学或社会科学中接触到有关基因和遗传力说法的学生;以及普通读者。全书可以分几次读完。

实用的阅读计划如下:

  • 按顺序阅读。 第1–2章确立了基因是什么以及这一答案如何形成,后面各章都以此为基础。
  • 细读第5章。 遗传力是生物学以外最常被误解的概念。把群体层面的定义写下来,并检查每个例子(身高、精神疾病、智商)是如何使用它的。
  • 关注应用可读第4章。 法医学、亲子鉴定、祖源检测和种族问题集中在这一章。
  • 以结论收尾, 然后重读与课程最相关的“基因”含义所对应的章节。

本书提供概念但没有习题,因此应同时用 Thomas 或 Griffiths 等教材练习孟德尔杂交和系谱分析题。术语表在阅读其他材料时也可用于快速查对。