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导读
引用
Lorch, M. (2021). Biochemistry: A Very Short Introduction. Oxford University Press.
章节概要
本书是牛津“通识读本”(Very Short Introductions)系列第674种,为小开本初版,正文约125页,共8章,另有前言、插图目录、参考文献、延伸阅读和索引。作者是赫尔大学化学与生物化学系主任,同时也是该校的科学传播与公众参与教授。出版社把生物化学描述为研究细胞内的反应、这些反应所生成、改变和分解的分子,以及构成细胞机器与结构的大分子(DNA、蛋白质、碳水化合物、细胞骨架)的学科。据介绍,本书讲述该领域的核心概念以及相关历史人物和他们所研究的分子,然后讨论当前的科学与创新,以及生物化学与生物技术、合成生物学之间的关系。介绍文字中还以青霉素、阿司匹林等药物和肉毒杆菌毒素为例,说明化学如何改变生化过程。
第1章:生物化学的源头
这是篇幅最长的一章(约23页),追溯这一领域的历史,并把它与最古老的生物技术之一——发酵——联系起来。以历史开篇,确立了本书通过科学背后的人物与实验来介绍科学的写法。
第2章:水、脂质与碳水化合物
这是讨论生命基本小分子的简短一章。它解释水的极性为何使水成为良好的溶剂,脂质在储存能量、信号传递和充当结构材料方面的作用,以及碳水化合物作为细胞燃料和结构支架的双重角色,并介绍作为构件的核苷酸。
第3章:蛋白质:自然界的纳米机器
蛋白质被呈现为细胞的主要机器。本章把蛋白质的结构与功能联系起来,说明翻译后修饰如何在20种标准氨基酸之外扩展化学多样性,最后讨论酶动力学和蛋白质折叠问题。
第4章:核酸:生命的蓝图
正如标题所示,本章介绍作为遗传信息储存和传递分子的 DNA 与 RNA,完成了从第2、3章开始的对主要生物分子类别的概览。
第5章:为细胞提供动力:生物能学
本章从分子转向能量:细胞如何获取并利用驱动其化学反应的能量。
第6章:DNA 的制造与维护
这是讨论核酸的第二章,讲 DNA 如何被合成和维护,把第4章的结构性叙述延伸到复制和保存遗传物质的过程。
第7章:在细胞内追踪生物化学
本章转向如何在活细胞内观察生物化学过程,这与出版社所说的介绍该领域当前科学与创新相呼应。
第8章:生物技术与合成生物学
最后一章讨论利用生物化学知识操控生命系统,也就是出版社所称作为全书收尾主题的生物化学、生物技术与合成生物学之间的相互作用。
核心概念
第1–2章:历史与小分子
- 发酵:微生物对糖的转化,是最古老的生物技术之一,也是生物化学史的起点。
- 水的极性:水分子中电荷分布不均,使水成为生命分子的良好溶剂。
- 脂质:储存能量、传递信号并构成膜等结构的分子。
- 碳水化合物:糖及其聚合物,既用作燃料,也用作结构材料。
第3章:蛋白质
- 结构与功能:蛋白质的作用取决于其三维形状这一原理。
- 翻译后修饰:蛋白质合成后发生的化学变化,扩展了其构件的多样性。
- 酶动力学:研究酶催化反应速率的学科。
- 蛋白质折叠问题:一条氨基酸链如何形成其有功能的形状这一问题。
第4–6章:信息与能量
- 核酸:储存和传递遗传信息的分子 DNA 和 RNA。
- 生物能学:研究细胞如何获取和利用能量。
- DNA 的复制与维护:DNA 被复制并保持完整的过程。
第7–8章:方法与应用
- 细胞内的生物化学:在细胞环境中研究反应和分子。
- 合成生物学:在生物化学认识的基础上设计和构建新的生物部件与系统。
评析
优点
- 名副其实的入门概览。 八个简短的章节涵盖了学科历史、主要生物分子类别、能量、DNA 的处理、研究细胞的方法以及应用,对这样一本小书而言覆盖面相当广。
- 历史与人物。 以一个较长的历史章节开篇,并在全书中介绍科学家及其研究的分子,让读者不仅了解生物化学知识是什么,也了解这些知识是如何获得的。
- 当代科学与应用。 八章中有两章讨论当今的研究方法以及生物技术与合成生物学,出版社所举的例子(青霉素、阿司匹林、肉毒杆菌毒素)把化学与医学和日常生活联系起来。
- 出自科学传播者之手。 作者既领导一所大学的化学与生物化学系,又担任科学传播与公众参与教授,这样的背景很适合撰写面向初学者的读物。
局限
- 每个主题都讲得很简略。 全书约125页,例如讨论水、脂质与碳水化合物的一章只有约10页,没有篇幅详细介绍化学结构、进行定量讨论或提供练习题。
- 没有代谢章节。 除了一章生物能学之外,目录中没有关于代谢途径的章节;需要了解糖酵解、柠檬酸循环或脂肪酸与氨基酸代谢的读者,必须求助于教科书。
- 是概览而非课程教材。 目录中看不到习题或练习,本书无法替代有考试的课程所用的教科书。
在课程中的定位
本书是这门生物化学课程中最短、技术性最低的一本,最好在第一门课开始之前或刚开始时阅读。Goodsell 的 The Machinery of Life 是它的天然搭档:书中按真实比例、以真实拥挤程度描绘分子的画作,能把 Lorch 用文字描述的内容——尤其是蛋白质和细胞两章——变得具体可感。课程本身则由入门教科书接手:McKee 与 McKee 的 Biochemistry: The Molecular Basis of Life(为化学基础有限的学生编写)、Pratt 与 Cornely 的 Essential Biochemistry 以及 Hines 等人的 Biochemistry: A Short Course,都结合习题讲解结构、酶、代谢和遗传信息。
篇幅更长的教科书(Berg 等人的 Biochemistry、Lehninger Principles of Biochemistry、Voet、Voet 与 Pratt 的 Fundamentals of Biochemistry、Appling 等人的 Biochemistry: Concepts and Connections、Miesfeld 与 McEvoy 的 Biochemistry)是供整套课程使用的综合性教材。Kuriyan 等人的 The Molecules of Life 从物理化学角度解释大分子,McMurry 与 Begley 的 The Organic Chemistry of Biological Pathways 从反应机理角度解释代谢,两者都适合已学完第一门课的读者。
如何使用本书
本书适合即将开始学习生物化学的高中毕业生和大一学生,希望在深入课程之前获得概览的化学、生物学或医学专业学生,以及普通读者。具备一定的中学化学和生物学知识会读得更顺畅。
实用的阅读计划:
- 在开课前从头读到尾。 本书分几次即可读完,其顺序(历史、小分子、蛋白质、核酸、能量、DNA 相关过程、方法、应用)为这门学科提供了一张地图。
- 课程预习的核心内容: 第2–5章,对应大多数教科书的开篇单元(水与生物分子、蛋白质结构与酶、核酸、生物能学)。
- 用于激发兴趣和了解背景: 讲学科历史的第1章,以及讲当前方法与应用的第7–8章,它们展示了教科书内容的去向。
- 利用书末的延伸阅读, 为任何主题找到下一本书。
阅读时,把每章提到的分子和过程列成清单,之后再查它们出现在课程教科书的哪些地方;教科书会补上这本小书所略去的结构、机理和习题。把第3章与 Goodsell 书中的蛋白质插图对照阅读,是牢固建立“蛋白质是机器”这一印象的好办法。
