生物学

Computational Genomics with R

Altuna Akalin

英文原名: Computational Genomics with R

完整计算基因组教材,把基因组生物学、R、统计与高通量测量的可重复分析整合起来,适合跨专业读者按已有背景选择学习起点。

需要的基础

基础分子生物学与统计有帮助,但书中按背景提供不同起点:生物读者可先学R,计算背景读者应先补基因组组织、调控与实验测量。

出版年份
2020
难度等级
中级
学术层次
本科
computational genomicsRgenomic data analysis

01 / 导读

导读

适合谁

适合从生物、医学或定量学科进入基因组数据分析的高年级本科及研究生初期。作者明确考虑不同背景,帮助把计算程序联系到产生数据的检测和生物问题。

需要的基础

基础分子生物学与统计有帮助,但书中按背景提供不同起点:生物读者可先学R,计算背景读者应先补基因组组织、调控与实验测量。

覆盖内容

由基因组生物学、高通量技术与R基础进入数据处理、统计探索和基因组分析流程,例子覆盖常见测量。计算与解释并重,工具围绕科学任务组织,不是互不相连的命令集合。

如何使用

选小数据,运行前记录检测方式、实验单位、生物比较与变异来源;保留原始输入,用脚本记录转换。拟合前检查质量和样本关系,改变过滤或归一化时说明假设变化并比较后果。重现例子后,再列迁移到另一实验需要的检查。

版本与来源

作者完整在线书署2020年9月30日,在线正文CC BY-NC-SA 4.0,软件与数据另核条件。本次采用完整阅读版而非出版社预览;软件包升级可能需对例子作小范围调整,仍应保留分析逻辑。

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