01 / 导读
导读
引用
Miesfeld, R. L., & McEvoy, M. M. (2021). Biochemistry (2nd ed.). W. W. Norton.
章节概要
第2版共5部23章,约1,400页。两位作者分别任教于亚利桑那大学和加州大学洛杉矶分校,他们把本书介绍为围绕三大主题组织的教材:结构与功能的关系、能量转换过程之间的相互依存,以及信号转导在代谢调控中的作用。出版社还说,本书用“everyday biochemistry(日常生物化学)”的例子来说明各个主题为什么重要。
第1部:生物化学原理(第1–3章)
第1章“生物化学原理”之后是“物理生物化学:能量转换、水与膜”(第2章)和“核酸的结构与功能”(第3章)。能量转换、水和膜因此集中在开头的一章里,核酸则排在蛋白质之前介绍。
第2部:蛋白质生物化学(第4–8章)
这一部分从“蛋白质结构”(4)讲到“蛋白质生物化学的方法”(5)、“蛋白质功能”(6)和“酶的机制”(7)。最后是“细胞信号系统”(8),所以信号转导是在代谢之前而不是之后介绍的。
第3部:能量转换途径(第9–12章)
四章沿着能量的流向展开:“糖酵解:代谢调控的范例”(9)、“柠檬酸循环”(10)、“氧化磷酸化”(11)和“光合作用”(12)。第9章的标题表明,糖酵解不仅用来讲各个步骤,也用来介绍一条途径是如何被调控的。
第4部:代谢调控(第13–19章)
这一部分涵盖“糖类的结构与功能”(13)和“糖代谢”(14)、“脂质的结构与功能”(15)和“脂质代谢”(16)、“氨基酸代谢”(17)和“核苷酸代谢”(18),并以“代谢整合”(19)收尾。糖类和脂质各自是一章结构加一章代谢,氨基酸和核苷酸各有一章代谢(它们的结构在前面的第3章和第4章出现),最后一章把各条途径联系起来。
第5部:基因组调控(第20–23章)
全书以信息流的生物化学收尾:“DNA复制、修复与重组”(20)、“RNA合成、加工与基因沉默”(21)、“蛋白质合成、翻译后修饰与运输”(22)和“基因调控”(23)。
核心概念
第1–2部:原理与蛋白质生物化学
- 结构与功能的关系:出版社点明的三大主题之一,在第4至第7章中展开。
- 酶的机制:酶如何催化反应(第7章);出版社说第2版对生物过程背后的化学机制给予了新的重视。
- 细胞信号系统:第8章的各条途径,排在代谢之前介绍。
第3–4部:能量转换与代谢调控
- 代谢调控:对途径的控制,第9章通过糖酵解引入。
- 能量转换:糖酵解、柠檬酸循环、氧化磷酸化和光合作用的衔接(第9至第12章)。
- 代谢整合:糖、脂质、氨基酸和核苷酸的代谢如何协调(第19章)。
第5部:基因组调控
- 基因沉默:在第21章中与RNA合成和加工放在一起。
- 翻译后修饰与运输:蛋白质合成一章(22)的一部分。
- 基因调控:本书最后一章(第23章)。
评析
优点
- 明确面向教学而非查阅。 出版社说作者是为本科读者写作的,并与它所说的那种“为教师写的百科全书式”教材相对照,强调的是大主题,而不是面面俱到。这是出版社自己的表述。
- 机制与情境合于一书。 出版社的描述把“everyday biochemistry”的例子与生物学和化学的平衡结合起来,第2版增加了“Your Turn”批判性思维练习,并新增了CRISPR和冷冻电镜的内容。目录与此吻合:第2部为酶的机制单列一章,细胞信号和代谢整合也各有单独的章。
- 便于复习的结构。 第4部中糖类和脂质各有一对章(结构与功能,然后是代谢),第3部的能量途径被归在一起,便于一次复习一组途径。
- 数字资源。 电子书包含可动的3D分子,Smartwork课程有使用分子查看器的题目,有助于结构与功能这一主题的学习。
局限
- 篇幅很长。 23章约1,400页,超出一学期课程能完整讲授的量,目录也没有标出可选章节,因此教师和自学者必须决定略去什么。
- 出版社页面未说明预备知识。 对化学机制的重视意味着需要普通化学,有机化学也会有帮助,但这是根据目录和关于化学类题目扩充的说明做出的推断,并非明确要求。
- 质量方面的说法来自出版社。 关于可读性和图示质量的说法来自出版社;在采用本书之前,不妨先看一章样章。
- 信号转导靠前。 把细胞信号放在代谢之前的第8章,有利于调控这一主题,但读者会先学到信号转导,之后才遇到它所调控的途径。
在课程中的定位
Miesfeld和McEvoy是希望化学与生物学兼顾的本科生物化学课程的主教材。在本书单中,最接近的替代选择是Voet、Voet和Pratt的 Fundamentals of Biochemistry(以化学上的严谨处理主题,全书运用热力学和反应机制),以及内容全面的 Lehninger Principles of Biochemistry。Miesfeld和McEvoy把重心放在出版社所说的结构与功能、能量转换和信号转导这些主题上,以及日常的例子上。
作为较轻松的起点,Trudy McKee和James McKee的 Biochemistry: The Molecular Basis of Life 是为化学背景有限的学生写的,Pratt和Cornely的 Essential Biochemistry 是为一学期入门课设计的简明教材。Kuriyan、Konforti和Wemmer的 The Molecules of Life 通过大分子的物理化学来讲解生物化学,适合学完入门课后想了解热力学和动力学一面的读者。
如何使用本书
本书适合生物学、生物化学、化学和医学预科专业修读一到两学期生物化学课程的本科生。读者应学过普通化学;由于强调机制,有机化学也会有用。
一个实用的读法是把第1部和第2部作为基础,在第4、6、7章(蛋白质结构、功能和酶的机制)上花最多时间,把第5章当作方法参考。第3部和第4部的代谢章节(9–12、14、16–19)构成典型课程的代谢核心;结构章第13和15章可作为各代谢章的引入来读。第5部可以与分子生物学课程一起讲授,也可用来对DNA、RNA和蛋白质合成做一次综合巩固。
学习时,重画每条途径并标出调控点,把第9章的调控主题当作其余各章的模板。做“Your Turn”练习;如果能用电子书,可以在读第4、6、7章时配合3D分子视图。
