01 / 導讀
導讀
引用
Karp, G., Iwasa, J., & Marshall, W. (2020). Karp's Cell and Molecular Biology (9th ed.). Wiley.
章節概要
第9版共18章,約944頁。除正文外,目錄中還列出三類反覆出現的專欄:「Human Perspective」把某一主題與疾病連結起來,「Experimental Pathways」回溯某項發現是如何確立的,而本版新增的「Green Cells」(植物細胞生物學)與「Engineering Linkage」(生物工程)兩類小節,則出現在第1至第17章的每一章中。出版社把這兩類新增小節(各自附有評量題)作為本版的主要新增內容加以介紹。
第1–2章:細胞與分子生物學研究導論;生命的化學基礎
第1章從細胞的發現及其基本特性談起,進入兩大類根本不同的細胞(原核細胞與真核細胞),隨後討論病毒與類病毒。第2章涵蓋共價鍵與非共價鍵、酸、鹼與緩衝液,以及四類生物分子(醣類、脂質、蛋白質和核酸)。四類生物分子一節從第53頁延續到第95頁,占了本章的大部分,先談蛋白質的結構與摺疊,本章最後以複雜巨分子結構的形成收尾。
第3章:生物能量學、酶與代謝
先談熱力學與生物能量學,再談作為生物催化劑的酶(包括催化機制),最後概述代謝及其調節。
第4章:質膜的結構與功能
討論膜的化學組成、膜蛋白與膜脂質、流動性與質膜的動態特性、物質的跨膜移動,以及膜電位與神經衝動。
第5–6章:有氧呼吸與粒線體;光合作用與葉綠體
兩個能量轉換章節在結構上彼此對應。第5章涵蓋粒線體的結構、有氧代謝、質子動力與ATP形成的機器,另有一節談過氧化體。第6章涵蓋光合作用的起源、葉綠體結構、光的吸收、反應中心、光磷酸化與二氧化碳固定。
第7章:細胞與其環境的交互作用
討論細胞外物質、細胞間黏附、緊密連接、細胞間通訊與細胞壁,把細胞視為組織的一部分來考察。
第8章:細胞質膜系統:結構、功能與膜運輸
先概述內膜系統及其研究方法,然後依序談內質網、高基氏體、囊泡運輸、溶小體與內噬作用途徑。本章最後談過氧化體、粒線體與葉綠體對蛋白質的轉譯後攝取。
第9章:細胞骨架與細胞運動
涵蓋微管、動力蛋白質(馬達蛋白)、微管組織中心、纖毛與鞭毛、中間絲、肌動蛋白與肌凝蛋白、肌肉收縮、肌動蛋白結合蛋白、細胞運動,以及細菌的細胞骨架。
第10–11章:基因與基因體的本質;中心法則:從DNA到RNA再到蛋白質
分子遺傳學從這裡開始。第10章循著基因概念的發展展開,從染色體是遺傳資訊的載體,談到基因的化學本質,再談基因體的複雜性、穩定性與定序。第11章涵蓋原核與真核細胞中的轉錄,核糖體RNA、轉運RNA與傳訊RNA的加工,小型調控RNA,CRISPR及其他非編碼RNA,以及遺傳密碼與轉譯。
第12–13章:基因表現的調控;DNA複製與修復
第12章涵蓋細菌中的調控、核膜、染色體與染色質、有組織的細胞核,以及轉錄、RNA加工、轉譯與轉譯後各層次的調控。第13章涵蓋細菌、病毒與真核細胞中的複製、DNA聚合酶與DNA修復。
第14–15章:細胞分裂;細胞訊號與訊號傳遞
第14章談細胞週期、有絲分裂與細胞質分裂,以及減數分裂。第15章談訊號系統的基本要素、G蛋白耦合受體與第二傳訊者、蛋白質酪胺酸磷酸化、作為細胞內傳訊者的鈣與一氧化氮、不同訊號路徑之間的交叉對話,以及細胞凋亡。
第16–17章:癌症;免疫反應
第16章涵蓋癌細胞的基本特性與成因、作為遺傳疾病的癌症,以及對抗癌症的策略。第17章涵蓋選殖選擇學說、B淋巴球與T淋巴球、免疫的細胞與分子基礎中的若干專題,以及淋巴球活化中的訊號傳遞路徑。
第18章:細胞與分子生物學技術
全書末尾的方法章:光學顯微鏡、電子顯微鏡與原子力顯微鏡、放射性同位素、細胞培養、離心分離、蛋白質與核酸的分離純化、雜交、重組DNA、PCR、DNA定序、基因庫、基因轉移、基因編輯與靜默,以及抗體的使用。
核心概念
第1–9章:細胞、能量、膜與細胞骨架
- 原核細胞與真核細胞:第1章比較的兩大類根本不同的細胞。
- 質子動力:第5章用來解釋ATP形成機器如何運作的梯度。
- 內膜系統:第8章當作一個相互連通的系統來討論的膜區室與囊泡運輸。
- 動力蛋白質(馬達蛋白):第9章中的驅動蛋白與動力蛋白,以及肌肉收縮中的肌凝蛋白。
第10–15章:基因、基因表現與訊號
- 中心法則:從DNA到RNA再到蛋白質的資訊流,是第11章的組織概念。
- 染色質:染色體的結構及其在第12章基因表現調控中的作用。
- 訊號傳遞:第15章的受體、第二傳訊者與蛋白質磷酸化。
- 細胞凋亡:程序性細胞死亡,位於第15章末尾。
第16–18章:癌症、免疫與方法
- 作為遺傳疾病的癌症:第16.3節,前面有一節談癌症的成因。
- 選殖選擇學說:第17.3節將其應用於B細胞。
- 重組DNA技術與PCR:第18章中核心的分子技術。
評析
優點
- 明確的實驗取向。 出版社把本書描述為幫助學生把關鍵概念與實驗連結起來,從而理解「我們是怎麼知道的」。這一點在目錄中清楚可見:列出了13個「Experimental Pathways」專欄,其中包括真核細胞的起源、基因的化學本質、RNA作為催化劑的作用、MPF的發現與特性研究,以及致癌基因的發現。
- 篇幅適中,附加內容可取捨。 出版社把本書定位為篇幅適中、行文親切,並把各特色小節描述為供教師按需選用的選項,適合想要側重某些分支學科的教師。讀者可以以正文為主線,把各個專欄當作可選內容。
- 涵蓋標準課程的廣度。 一本書涵蓋細胞的化學、生物能量學、膜、運輸、細胞骨架、基因表現、訊號傳遞、癌症與免疫,書末還有專門的技術章。
局限
- 許多新內容在設計上是可選的。 「Green Cells」與「Engineering Linkage」小節是本版新增的,出現在第1至第17章,依所列頁碼範圍來看,通常各占一兩頁。不談植物生物學或生物工程的課程會略過它們,因此不應算作必讀內容。
- 技術集中在書末。 第18章把方法(從顯微鏡到基因編輯與抗體)集中在一處,排在依賴這些方法的主題之後。讀者在前面章節遇到不熟悉的方法時,可能需要先翻到第18章。
- 範圍廣意味著需要取捨。 18章涵蓋化學、能量轉換、膜、細胞骨架、基因表現、訊號傳遞、癌症與免疫,超出多數單一課程能夠完整使用的量,因此教師或讀者需要選擇哪些章節作為核心。
在課程中的定位
Karp是標準的二年級細胞生物學課程的主教材。在本課程的其他書中,Becker's World of the Cell 是最接近的替代選擇:兩者都是單冊的大學部教材。Karp在每個主題上為實驗歷史留出更多篇幅,並把基因表現、細胞分裂、癌症與免疫反應分別放在獨立章節中。Becker共26章,糖解與發酵、有氧呼吸與光合作用各有單獨的章,還有關於神經元訊號的章,但目錄中沒有免疫章。
Essential Cell Biology 是為入門課程而寫的,對初學者來說起點更平緩。Molecular Biology of the Cell 是想了解Karp之外更多細節時可參考的更全面的著作,而Pollard的 Cell Biology 由把分子結構與物理機制放在解釋核心的研究者撰寫,適合希望了解該學科物理一面的讀者。The Cell: A Very Short Introduction 是非技術性的概覽,可以先讀。
如何使用本書
本書適合已有入門生物學與普通化學基礎、正在修讀細胞生物學核心課程的生物學、生物化學與生物醫學科系二年級學生。它也適合不久將接觸原始文獻的學生,因為「Experimental Pathways」專欄展示了結論是如何得出的。
一個實用的讀法:如果熟悉化學,可以快速讀完第1–3章,然後依序讀第4–9章作為結構方面的核心(膜、粒線體、葉綠體、細胞外環境、運輸與細胞骨架)。第10–13章構成關於基因與基因表現的相對獨立的一塊,可與遺傳學或分子生物學課程配合。第14–17章(細胞分裂、訊號傳遞、癌症與免疫)可以依課程大綱調整順序。第18章可以在前面章節出現某種方法時,作為參考來查閱。
在選擇附加內容時,對強調實驗的課程來說「Experimental Pathways」專欄最有用;「Human Perspective」專欄適合有醫學志向的讀者;當課程涉及植物生物學或生物工程時,值得閱讀「Green Cells」與「Engineering Linkage」。出版社表示,每章的「Green Cells」與「Engineering Linkage」小節都附有各自的評量題,如果課程使用線上教材,可以留意一下。
